Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C6orf47O95873 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms