Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC28A2O43868 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms