Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MSH5O43196 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms