Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms