Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms