Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF6Q9Y252 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms