Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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