Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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