Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms