Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms