Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRDM8Q9NQV8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRDM8Q9NQV8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRDM8Q9NQV8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRDM8Q9NQV8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRDM8Q9NQV8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms