Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms