Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms