Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms