Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCNX1Q96RV3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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