Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARXQ96QS3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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