Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHIPQ8WWQ0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PHIPQ8WWQ0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms