Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms