Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKAP1Q86WV1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms