Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PBRM1Q86U86 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms