Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms