Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18B1Q6NT16 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms