Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KHDC3LQ587J8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KHDC3LQ587J8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms