Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms