Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms