Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN3Q16667 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN3Q16667 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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