Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
USF2Q15853 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USF2Q15853 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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