Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCM1Q15154 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms