Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMCO1Q147U7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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