Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR4Q13639 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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