Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BFSP2Q13515 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms