Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SNTB2Q13425 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNTB2Q13425 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms