Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CLN3Q13286 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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