Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK18Q07002 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK18Q07002 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms