Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3AQ05086 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3AQ05086 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms