Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP1Q00587 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP1Q00587 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms