Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIP4K2BP78356 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIP4K2BP78356 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms