Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms