Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA3P59666 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms