Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CABP4P57796 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CABP4P57796 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CABP4P57796 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms