Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms