Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HOXA1P49639 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXA1P49639 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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