Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ME1P48163 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ME1P48163 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ME1P48163 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ME1P48163 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ME1P48163 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms