Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTKP29376 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTKP29376 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTKP29376 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTKP29376 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTKP29376 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTKP29376 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms