Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNRPBP14678 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNRPBP14678 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms