Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms