Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA4FO95754 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA4FO95754 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms