Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms