Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIN3BO75182 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms