Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMDSO60547 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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